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Los sistemas basados en Debian utilizan el archivo /etc/hostname para leer el hostname del sistema durante el inicio del mismo y se configura utilizando el script /etc/init.d/hostname.sh
Entramos a la consola y escribimos:
nano /etc/hostname
Cambiamos al nuevo hostname. Luego guardamos el archivo(Control + o) y cerramos (Control + x).
Por último, volvemos a escribir en la consola:
/etc/init.d/hostname.sh start
Ahora solo reiniciamos el sistema y ya aparecerá de forma permanentemente el nuevo hostname.
Fuente: Linux-OS