Ya se encuentra disponible calibre 1.6.0 y quería tenerlo en Ubuntu 13.04, así que manos a la obra.

Entramos a la consola y escribimos:
sudo python -c "import sys; py3 = sys.version_info[0] > 2; u = __import__('urllib.request' if py3 else 'urllib', fromlist=1); exec(u.urlopen('http://status.calibre-ebook.com/linux_installer').read()); main(install_dir='/opt')"

Ahora volvemos a escribir en la consola:
calibre


Ahora solo deben configurarlo y luego ya podrán agregar los documentos EPUB, etc.