Ya se encuentra disponible calibre 2.2.0 y quería tenerlo en Debian Wheezy, así que manos a la obra.

Entramos a la consola y escribimos:
sudo -v && wget -nv -O- https://raw.githubusercontent.com/kovidgoyal/calibre/master/setup/linux-installer.py | sudo python -c "import sys; main=lambda:sys.stderr.write('Download failed\n'); exec(sys.stdin.read()); main()"


Ahora volvemos a escribir en la consola:
calibre


Ahora solo deben configurarlo y luego ya podrán agregar los documentos EPUB, etc.