Frecuentemente se están actualizando varias distros como por ejemplo Ubuntu y es necesario verificar cuales procesos se deben de reiniciar. Manos a la obra.

Obs:

•  Utilizo Ubuntu 16.04 LTS Xenial Xerus de 64 bits, pero debería de funcionar en las versiones recientes.

Entramos a la terminal y tecleamos lo siguiente:
sudo apt update
sudo apt install debian-goodies
sudo apt clean && sudo apt autoclean

Ahora a verificar:
sudo checkrestart

Sale por pantalla:
lsof: WARNING: can't stat() fuse.gvfsd-fuse file system /run/user/1000/gvfs
Output information may be incomplete.
Found 0 processes using old versions of upgraded files

Fuente: nix Craft